Optimierung von zusammengesetzten DNA-Buchstaben für die Codierung von Informationen mit hoher Dichte

Beschreibung

Um DNA als vielversprechendes Medium für die routinemäßige langfristige Informationsspeicherung zu nutzen, ist eine DNA-Synthese im großen Maßstab erforderlich. Die photolithographische Synthese mit modifizierten Phosphoramiditen mit BzNPPOC als photolabiler 5′-Schutzgruppe macht dies auf Mikroarrays möglich. Um die in der DNA gespeicherte Informationsdichte zu erhöhen, wird das übliche Alphabet von 4 Basen durch zusammengesetzte DNA-Buchstaben, Mischungen der normalen Basen, erweitert.
Diese zusammengesetzten DNA-Buchstaben bestehen aus zwei- bis vierbasigen Mischungen mit vordefinierten Verhältnissen, die äquimolar oder nicht-äquimolar sind, so dass unterschiedliche Mischungsverhältnisse der gleichen Basen auch zu weiteren Ergänzungen eines erweiterten Alphabets beitragen. Die zufällige Kopplung der einzelnen Komponenten in den Mischungen kann durch Sequenzierung ausgelesen werden, wobei das Verhältnis in den Reads das Vorkommen der Basen in den Mischungen darstellt. Diese spezifischen Verhältnisse wurden entweder durch Mischen on-the-fly oder durch manuelles Mischen erzeugt. Ziel ist es, die Grenzen für die Synthese und Sequenzierung dieser Mischungen zu ermitteln und die spezifischen Anforderungen an das Sequenzdesign und die Mischungsverhältnisse zu verstehen, insbesondere im Hinblick auf die Verwendung von nur drei oder zwei verschiedenen Phosphoramiditen.

Zeitraum	19 Juni 2025
Ereignistitel	Storage and Computing with DNA
Veranstaltungstyp	Konferenz
Ort	Paris, FrankreichAuf Karte anzeigen
Bekanntheitsgrad	International